Variabel系統(tǒng)面世 能準確識別病毒的“低頻變體”

面對棘手的疫情，如果研究人員能夠找到隱藏在SARS-CoV-2變異體中的細節(jié)，那就好辦了。

好消息是，萊斯大學喬治-R-布朗工程學院開發(fā)的一個新程序將使之成為可能，至少對于“宿主內變體”來說，即那些出現(xiàn)在同一新冠患者的變體。

由萊斯大學計算機科學家Todd Treangen和研究生Yunxi Liu領導的團隊開發(fā)了Variabel，Variabel使用低成本的納米孔測序技術來識別病毒感染后的宿主內變異。它能準確識別新冠病毒的“低頻變體”，從而在它們有機會傳播之前，識別潛在的破壞性變體。

該實驗室在對感染埃博拉和諾瓦克病毒的病人的序列測序進行Variabel測試后同樣取得了成功。

研究人員聲稱，Variabel的關鍵是它能夠區(qū)分真正變體和測序錯誤。Variabel為宿主內部變異的測序打開了大門，這最終可能有助于發(fā)現(xiàn)未來特定的變異。

《自然·通訊》上詳細介紹了這個開源程序，可在https://gitlab.com/treangenlab/variabel上下載。

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